神雕大侠杨过和小龙女在古墓中练成绝世武功后,下山去帮助郭靖、黄蓉夫妇抵抗外敌。两人来到襄阳城外时遇到金轮法王和蒙古大汗蒙哥等高手的挑战。小龙女的姑姑李萍为报杀夫之仇而找上门来要杀死他们二人;此时郭芙出现欲与杨过相认并与之发生打斗(见《射雕英雄传》),最后因杨过误伤其母而使二人在误会开。后来杨过被一灯大师所救并被收留在其门下习武。在此期间他结识了同门师兄弟程英及陆无双姐妹俩以及完颜康等人,并与她们产生了爱情关系。
在绝情谷底断肠崖上杨过受到裘千尺的百般折磨,最终与其父义助铁掌水上漂周伯通将其救出。之后三人一同前往全真教寻找洪七公疗治内伤的方法。(此段情节参考自金庸小说:《倚天屠龙记》第16章)
三人离开绝情谷后再度踏上征途找寻其他武林人士相助抗元卫国。途中又遇上了霍都和金轮法王的阻截:由于霍都和金轮都是好战分子因此三人与之一番恶斗。经过一番苦战后终使众人脱险回到中原。
返回大都皇宫后一行人遇到了前来行刺皇帝的多尔衮及其手下侍卫统领罗立如一伙人等,双方展开了一场激烈的战斗并最终将敌人打败。但就在众人都以为可以松口气的时候却突然遭到一股神秘力量的攻击导致多人受伤昏迷不醒且兵器尽失。原来这是当年南宋末年忽必烈派兵南侵之时曾受重伤的大理国镇远大将军韩宝驹为了向忽必烈的孙子忽辛求取解药以延续大理国的生命而在暗中布置下的圈套——只要有人能破坏掉这些机关就可以获得解药从而挽救自己的性命......于是乎一场惊心动魄的正邪之战由此拉开帷幕!
